علی لاریجانی، مشاور رهبر جمهوری اسلامی اعلام کرد که در جریان جنگ ۱۲ روزه، اسرائیل قصد داشت علی خامنه‌ای را مورد هدف قرار دهد. لاریجانی گفت «اسرائیل به محل جلسه شورای عالی امنیت ملی حمله کرد تا سران قوا و کشور و افراد مهم را از بین ببرد و سراغ رهبری بیاید، اما موفق نشد.»
علی خامنه‌ای، رهبر جمهور اسلامی ایران پس از حملات مرگبار اسرائيل به پایگاه‌ها و مقر فرماندهی ارتش و سپاه این کشور، تاکنون در انظار عمومی ظاهر نشده است.
در جریان جنگ ۱۲ روز ایران و اسرائيل، امریکا بارها اعلام کرد که محل اقامت رهبر جمهوری اسلامی را می‌داند اما قصد کشتن او را ندارد.
دونالد ترامپ، رئيس‌جمهور امریکا ششم سرطان گفت: «من دقیقا می‌دانستم او در کجا پنهان شده بود و اجازه ندادم که اسرائیل یا نیروهای مسلح ایالات متحده که بی‌هیچ شکی بزرگ‌ترین و قدرتمندترین ارتش جهان هستند، جان او را بگیرند.»
علی لاریجانی روز یکشنبه، ۸ سرطان در مصاحبه با خبرگزاری دانشجو گفت که در روز اول حمله اسرائیل به ایران، یک تماس تهدیدآمیز از سوی اسرائيل دریافت کرده است.
او گفت:«یک نفر با من تماس گرفت و گفت ۱۲ ساعت وقت داری تا از ایران خارج یا از تهران فاصله بگیری، وگرنه به سرنوشت دوستانت مثل باقری و رشید دچار و به آن‌ها ملحق خواهی شد.»
دبیر پیشین شورای عالی امنیت ملی ایران همچنین گفت:«من از کد تماس‌گیرنده متوجه شدم از کجاست و پاسخ در خور نتانیاهو به او دادم.»
پیش از این، روزنامه واشنگتن‌پست در دوم سرطان با انتشار یک فایل صوتی، از کارزار مخفیانه و گسترده اسرائیل با هدف ارعاب فرماندهان نظامی و ایجاد شکاف و سردرگمی در میان مقام‌های عالی‌رتبه جمهوری اسلامی همزمان با آغاز جنگ خبر داد.
بر اساس این گزارش، در بخشی از این کارزار ماموران سرویس‌های امنیتی اسرائیل با تلفن شماری از مقام‌های ارشد حکومت ایران تماس می‌گیرند و به زبان فارسی به آن‌ها هشدار می‌دهند تنها در صورتی زنده خواهند ماند که از جمهوری اسلامی اعلام برائت کنند.
یک کارشناس صدا و سیما ششم تیر تماس موساد با فرماندهان نظامی جمهوری اسلامی برای اعلام برائت از حکومت ایران را تایید کرد.
